2024/12/9 13:12:00

组织总RNA提取方法

细胞样本收集及处理:

取适量(约50mg-100mg)组织(肺脏,肝脏,肿瘤等,为避免误差可取相同位置大小的组织样本),置于RNase-free EP管中,负八十保存。

 

试剂耗材准备:

电转,灭菌5ml EP管,装有无菌水的50 ml,卫生纸,镊子,三氯甲烷(氯仿),异丙醇,75 %无水乙醇(DEPC水配置),DEPC水,1.5 ml RNase-free EP管,RNase-free枪头,冰盒。

 

提取步骤:

1. 负八十冰箱取出样品,取适量组织(可统一称取相同质量的样本)样品置于5ml EP管中,加入500 μl Trizol浸没组织,用电转(3挡位)研磨组织(20~30s)直至粉碎(每个样品间隔用水清洗一遍转头,减少交叉污染),转移至1.5 ml RNase-free EP管中,再补加500 μl Trizol。放置于冰上裂解5min。(提前预冷离心机至4度)

2.加入200 μl 氯仿(三氯甲烷)(加入氯仿体积为Trizol体积的1/5),剧烈震荡(乳白红色),冰上静置10 min。

3.放置于预冷的离心机,离心(4度,12000 rpm,15 min),可见明显分三层(上层无色透明水相为RNA层,中间很薄的乳白色为DNA层,下层为红色为蛋白层,底部可见大组织块沉淀)。

4.小心缓慢吸取上清,约400 μl(宁可少吸,也不要多吸取),置于另一个新的1.5 ml RNase-free EP管中,加入等体积的异丙醇,上下颠倒混匀,常温静置放置15 min。

5.离心(4度,12000 rpm,15 min),可见白色沉淀(一般组织沉淀较大)。

6.弃上清,每管加入950 μl 75 %乙醇,上下颠倒混匀(切记不要用枪吹打混匀,这样会造成RNA溶解)。

7.离心(4度,12000 rpm,10 min),可见明显白色沉淀(组织沉淀一般比较大)。

8.离心后,弃掉上清,放入离心机再次瞬离,用10 ul 的移液器洗去残留液体, 开盖晾干(约5 min)。

9.每管根据沉淀大小加入适量DEPC水(一般30~50ul),吹打溶解RNA,十一楼酶标仪测浓度,OD值(260/280=1.8-2.0)标记,负八十保存。

备注:操作过程中佩戴口罩。

 

各试剂的作用:

1、Trizol

主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。

Trizol是从细胞和组织中提取总RNA的即用型试剂,在样品裂解或匀浆过程中,Trizol能保持RNA完整性。加入氯仿后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相,用异丙醇可沉淀回收RNA。

0.1%的8-羟基喹啉可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用。

异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。

β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键。

2、氯仿

为有机溶剂与水互不相溶,RNA(核糖核“酸”的盐型)是离子化合物,溶于水相。

3、异丙醇

能与与任意比例的水混合,因此加入异丙醇,能够夺取RNA/DNA周围的水分,RNA/DNA能够聚集而发生沉淀。

4、乙醇

起到洗涤的作用,一方面可以溶解一些沉淀中可能的有机物杂质,另一方面可以洗掉异丙醇、氯仿试剂,还可以溶解一部分蛋白质。

 

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