2024/11/20 9:58:00

一、准备试剂

1.台盼蓝染液:取台盼蓝粉剂,将其溶解在10mL的双蒸水当中配制成质量体积比为4%(4%w/v)的台盼蓝母液。在使用时,利用PBS缓冲液将母液稀释10倍,使其浓度达到0.4%,之后再与细胞悬液混合均匀。

2.BufferA:包含10mmol/L的HEPES(在4℃下pH值为7.9)、1.5mmol/L的氯化镁、10 mmol/L的氯化钾、0.5mmol/L的二硫苏糖醇(DTT)。若担心浆蛋白降解会对核蛋白产生影响,可以添加1mmol/L的苯甲基磺酰氟(PMSF)。

3.BufferB:含有20mmol/L的HEPES(pH值为7.9)、体积分数为25%的甘油、0.42mol/L的氯化钠、1.5mmol/L的氯化镁、0.2mmol/L的乙二胺四乙酸(EDTA)、0.5mmol/L的苯甲基磺酰氟(PMSF)、0.5mmol/L的二硫苏糖醇(DTT)。

 

二、实验步骤

1.使用胰酶将贴壁细胞消化下来,把这些细胞收集到1.5mL EP管中。4℃以300g的离心力离心5min。离心完成后,用PBS缓冲液对细胞进行洗涤(2次)。

2.弃上清,加入体积为细胞沉淀5倍的预冷Buffer A(每20μL的细胞沉淀加入100μL的Buffer A),之后轻轻吹打,使细胞在Buffer A中重新悬浮起来。

3.将上述细胞悬浮液在冰上放置10min,随后再次在4℃条件下,以300g的离心力离心5min。离心结束后,加入体积为其25倍的预冷Buffer A,并通过吹打操作让细胞重新悬浮。

4.把经过上述处理后的细胞悬液转移匀浆器中,准备进行匀浆操作。

5.在匀浆过程中,取出少量的细胞悬液,与等体积的0.4%台盼蓝染液混合均匀,接着在显微镜下观察细胞的破膜情况。如果观察到大部分细胞都被染成了蓝色,就停止匀浆操作;要是大部分细胞未被染成蓝色,则继续进行匀浆。

6.当大部分细胞的细胞膜被破坏后,将细胞悬液转移至Eppendorf管中,然后在4℃环境下,以25000g的离心力离心20min。

7.离心完成后,此时上清液中包含的是细胞裂解物中的胞浆成分,而沉淀部分则是核蛋白。

8.收集离心后的沉淀,向其中加入与沉淀等体积的预冷Buffer B,然后轻轻地吹打,使沉淀呈现悬浮状态。接着将悬浮液转移到干净的组织匀浆器中,以均匀的力度进行30次匀浆操作。

9.把经过匀浆的悬浮液转移到Eppendorf管中,放在冰上的低速摇床上振荡45min。

10.在4℃条件下,以25000g的离心力离心30min,收集得到的上清液即为细胞核蛋白

11.提取核蛋白后,可使用一些核蛋白(如H3蛋白、Lamin蛋白)作为对照蛋白,进行WB验证。

内源性circ-sirt1的敲除增强了TNF-α诱导的NF-κBp65核转位

 

三、注意事项

1.全部步骤均需于冰上操作。

2.第七步操作切勿触碰沉淀,可于沉淀上方留存极少量上清液,该上清液即为抽提所得的细胞浆蛋,不然会造成细胞浆蛋白的污染状况。

 

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