2025/12/1 14:14:00

一、预防RNA降解的措施

1.使用无RNase的耗材和试剂:

耗材:选择无RNase的枪头、离心管、移液器等,确保实验过程中不会引入RNase污染。

试剂:使用无RNase的水、缓冲液和酶类,如DEPC处理水、RNase抑制剂等。

2.优化样本采集和保存条件:

采集:尽量快速采集样本,减少样本在室温下的暴露时间。对于动物组织,可考虑在动物处死后立即取样,或使用液氮快速冷冻保存。

保存:样本采集后应立即置于液氮或-80℃冰箱中保存,避免反复冻融。对于需要长期保存的样本,可考虑使用RNA稳定剂或RNA保存液。

3.改进样本处理流程:

裂解:使用高效的裂解液,确保样本中的细胞或组织被充分裂解,释放出RNA。裂解过程中可加入RNase抑制剂,以抑制RNase的活性。

离心:离心时选择合适的转速和时间,确保样本中的杂质和蛋白质被有效去除,同时避免RNA的损失。

纯化:使用高效的RNA纯化柱或试剂盒,确保RNA的纯度和完整性。纯化过程中可加入DNase I处理,以去除基因组DNA的污染。

4.控制实验环境:

清洁:保持实验台面的清洁,定期使用RNase清除剂擦拭实验区域。

隔离:将RNA实验与其他可能产生RNase污染的实验(如DNA实验、蛋白质实验)分开进行,避免交叉污染。

个人防护:实验人员应佩戴手套、口罩和实验服,减少皮肤、呼吸和衣物上的RNase污染。

 

二、RNA降解后的补救措施

1.重新提取RNA:

如果RNA降解严重,且无法通过后续实验步骤进行补救,建议重新提取RNA。在重新提取时,应严格遵循上述预防RNA降解的措施,确保提取的RNA质量。

2.使用RNA修复试剂:

市面上有一些RNA修复试剂,可以在一定程度上修复部分降解的RNA。但这些试剂的效果有限,且可能不适用于所有类型的RNA降解。因此,在使用前应仔细阅读产品说明书,并进行预实验验证。

3.调整实验方案:

如果RNA降解程度较轻,且对实验结果影响不大,可以考虑调整实验方案。例如,在RT-PCR实验中,可以增加循环数或使用更敏感的引物;在RNA测序实验中,可以增加测序深度或使用更先进的测序技术。

 

三、特定样本类型的RNA提取注意事项

1.植物样本:

植物样本中含有大量的多糖和多酚类物质,这些物质可能干扰RNA的提取和纯化。因此,在提取植物RNA时,应选择适合植物样本的裂解液和纯化柱,并考虑加入多糖去除剂或多酚氧化酶抑制剂。

2.血液样本:

血液样本中含有大量的血红蛋白和免疫球蛋白,这些蛋白质可能干扰RNA的提取和纯化。因此,在提取血液RNA时,应选择适合血液样本的裂解液和纯化柱,并考虑加入红细胞裂解液或白细胞分离液。

3.FFPE样本(福尔马林固定石蜡包埋样本):

FFPE样本中的RNA可能因固定和包埋过程而发生降解和交联。因此,在提取FFPE样本RNA时,应选择适合FFPE样本的裂解液和纯化柱,并考虑使用脱蜡剂和蛋白酶K处理以去除石蜡和蛋白质污染。

 

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