一、基本原理
1.DNA 熔解性质：
DNA 双螺旋结构在一定条件下可以解链，这个过程称为变性。
DNA 50%发生变性时的温度称为熔解温度（Tm）。Tm 值主要取决于 DNA 分子中 GC 含量的多少，GC 含量越高，Tm 值越高。
2.变性梯度凝胶：
DGGE 将凝胶设置在双重变性条件下：温度 50~60℃，变性剂（如尿素和甲酰胺）浓度 0~100%。
凝胶中的变性剂浓度呈梯度增加，形成变性梯度。
3.DNA 片段迁移与分离：
当一双链 DNA 片段通过变性剂浓度呈梯度增加的凝胶时，该片段迁移至某一点，其变性剂浓度恰好相当于此段 DNA 的低熔点区的 Tm 值，此区便开始熔解，而高熔点区仍为双链。
这种局部解链的 DNA 分子迁移率发生改变，导致不同序列的 DNA 片段在凝胶中的迁移速度不同，从而实现分离。
二、分离机制
1.Tm 值差异：
不同序列的 DNA 片段由于其碱基组成不同，其 Tm 值也不同。
在变性梯度凝胶中，Tm 值较低的 DNA 片段在低浓度变性剂区域就开始解链，迁移速度减慢；而 Tm 值较高的 DNA 片段则在高浓度变性剂区域才开始解链，迁移速度相对较快。
2.GC 夹的作用：
为了提高 DGGE 的突变检出率，可以在 PCR 引物的 5' 端加上一个 30~40bp 的 GC 结构（称为 GC 夹）。
GC 夹具有非常高的解链温度，可以防止 DNA 片段在 DGGE 胶中完全解链，从而增加突变分子与野生型分子之间的电泳迁移率差异。
三、实验应用
DGGE 技术广泛应用于基因突变检测、微生物群落多样性分析等领域。通过 DGGE 图谱，可以直观地观察到不同样品中 DNA 片段的多样性和差异，进而进行进一步的分析和研究。
