一、样品制备
1.细胞/组织处理
快速操作:磷酸化修饰不稳定,需在冰上操作,缩短样品处理时间。
刺激条件优化:通过预实验确定最佳刺激时间(如EGF刺激5分钟)和浓度,避免过度刺激导致磷酸化信号下降。
裂解液选择:使用含磷酸酶抑制剂(如NaF、Na₃VO₄)和蛋白酶抑制剂的裂解液(如RIPA),现配现用以保持活性。
2.蛋白提取
低温裂解:4°C裂解细胞或组织,离心取上清,避免反复冻融。
定量与分装:用BCA法测定蛋白浓度,分装后-80°C保存,减少磷酸化修饰的降解。
二、电泳与转膜
1.电泳
凝胶配制:根据蛋白分子量选择合适浓度的SDS-PAGE胶(如8%-12%)。
上样量:磷酸化蛋白丰度低,可适当增加上样量(如30-50μg),但需避免过载导致条带变形。
2.转膜
湿转法:使用PVDF膜,转膜缓冲液中加入甲醇(20%)和SDS(0.0375%),低电压(100V)转膜1-2小时,确保小分子量蛋白充分转移。
转膜验证:丽春红染色或考马斯亮蓝染色确认转膜效率。
三、封闭与抗体孵育
1.封闭
封闭液选择:用5% BSA(TBST配制)封闭1小时,避免使用脱脂奶粉(含磷酸化酪蛋白,可能产生高背景)。
2.一抗孵育
抗体稀释:按说明书稀释磷酸化特异性抗体,推荐4°C过夜孵育,增强特异性结合。
对照设置:设置阳性对照(已知磷酸化样品)和阴性对照(未刺激样品),验证抗体特异性。
3.二抗孵育
二抗选择:使用HRP标记的二抗,室温孵育1小时,避免高背景。
洗膜:TBST洗膜3次,每次10分钟,摇床转速适中,避免过度洗涤导致信号丢失。
四、显影与数据分析
1.化学发光
底物选择:使用高灵敏度ECL底物,根据信号强度调整曝光时间(如10秒至5分钟)。
多通道成像:若需同时检测磷酸化和总蛋白,可用荧光二抗进行双色检测,减少条带剥离的误差。
2.数据分析
定量分析:用ImageJ软件测定条带灰度值,计算磷酸化蛋白与总蛋白的比值,排除上样量差异的影响。
重复实验:至少进行3次独立实验,确保结果可靠性。
五、常见问题与解决方案
1.高背景
原因:封闭不充分、抗体浓度过高、洗膜不彻底。
解决:优化封闭条件、降低抗体浓度、延长洗膜时间。
2.无信号或弱信号
原因:样品降解、抗体特异性差、上样量不足。
解决:检查样品保存条件、更换抗体、增加上样量。
3.非特异性条带
原因:抗体交叉反应、封闭液选择不当。
解决:优化抗体稀释比例、改用BSA封闭。