组织特异性在DNA甲基化中起着关键作用，不同组织类型的DNA甲基化模式存在差异，以下从CpG岛甲基化、基因表达调控、组织发育与分化关联、疾病易感性影响几个方面分析组织特异性对DNA甲基化的影响：
1.CpG岛甲基化差异：管家基因的启动子通常嵌入CpG岛中，且保持非甲基化状态，组织特异性基因则缺乏CpG岛。不同组织中，CpG岛的甲基化状态存在差异，这种差异与基因的特异性表达相关。例如，某些管家基因的启动子CpG岛在所有组织中保持非甲基化，以维持其基本表达；而一些组织特异性基因的调控区域CpG岛甲基化状态则因组织而异，从而控制基因的组织特异性表达。
2.基因表达调控：启动子区的CpG被甲基化时转录受到抑制，基因下游即非岛区的CpG甲基化不抑制基因的转录。不同组织中，DNA甲基化通过调控特定基因的启动子甲基化状态，实现对基因表达的精细调控。例如，在肝脏组织中，与代谢相关基因的启动子可能处于低甲基化状态，促进基因表达；而在肌肉组织中，这些基因的启动子可能被甲基化，从而抑制表达。
3.组织发育与分化关联：在组织发育和分化过程中，DNA甲基化模式会发生动态变化，这种变化具有组织特异性。例如，在胚胎发育过程中，不同组织的细胞会根据其发育命运建立特定的DNA甲基化模式，以维持细胞类型特异性基因的表达。这种组织特异性的DNA甲基化模式在细胞分化后得以稳定遗传，确保细胞类型的稳定性。
4.疾病易感性影响：异常的DNA甲基化模式与多种疾病相关，且这种异常具有组织特异性。例如，在癌症中，不同组织类型的肿瘤可能表现出特定的DNA甲基化改变。某些肿瘤抑制基因可能在特定组织的肿瘤中因启动子高甲基化而失活，而在其他组织中则不受影响。这种组织特异性的DNA甲基化异常为疾病的诊断和治疗提供了潜在的生物标志物和靶点。
