Western Blot(WB)是定性检测蛋白磷酸化水平的常用方法,以下是一些关于如何轻松搞定磷酸化蛋白的WB检测的建议:
一、实验准备
1.样品准备:
磷酸化是一个迅速的反应,因此取样品的过程要迅速,样品要新鲜,样品处理最好在冰上操作,操作时间尽量短。
用PBS洗涤细胞时,PBS需4℃预冷。如果是组织,提取蛋白时采用液氮研磨的方法,研磨器具最好提前预冷,保持低温状态。
提取磷酸化蛋白的裂解液最好是新鲜配制,裂解液中需加入蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂(如okadaic acid、NaF),以防止蛋白降解和磷酸酶去磷酸化作用。
根据检测的蛋白磷酸化位点是什么氨基酸,可能还需要加入其他抑制剂,如检测酪氨酸磷酸化时,需加入1μM的原钒酸钠。
2.抗体选择:
选择特异性好、灵敏度高的磷酸化抗体,这是WB检测成功的关键。
抗体需来自可靠的厂商,以保证抗体的质量和稳定性。
二、实验步骤
1.蛋白定量与上样:
使用BCA等方法对蛋白进行定量,确保每个凝胶孔中有足够的目的蛋白上样量。
将样品与上样缓冲液混合,遏制磷酸酶活性。上样前不要煮沸,以免破坏磷酸化位点。
2.SDS-PAGE分离与转膜:
使用SDS-PAGE凝胶对蛋白进行分离。
将分离后的蛋白转移到PVDF膜上,注意保持膜的湿润和完整性。
3.抗体孵育与检测:
使用特异性识别磷酸化蛋白的抗体进行孵育,孵育时间需足够长,以确保抗体与磷酸化蛋白的充分结合。
孵育结束后,使用洗涤液进行充分漂洗,以去除未结合的抗体。
使用化学发光或荧光底物进行检测,观察并记录结果。
三、实验优化与注意事项
1.提高检测灵敏度:
对于丰度低的磷酸化蛋白,可以先通过免疫沉淀(IP)等方法对目标蛋白进行富集,再进行WB检测。
使用高灵敏度的底物进行化学发光检测,以提高检测灵敏度。
2.减少非特异性结合:
在抗体孵育前,使用封闭液对膜进行封闭,以减少非特异性结合。
选择特异性好的抗体,避免抗体与样品中的其他蛋白质发生非特异性结合。
3.实验条件控制:
保持实验条件的稳定性和一致性,如温度、湿度、pH值等。
避免反复冻融样品和抗体,以减少蛋白降解和抗体失活。
4.数据解读与验证:
根据Markers比对压出的条带分子量是否正确。
使用strip液将原先结合上的磷酸化抗体及二抗洗去,然后用同一张膜检测总蛋白水平,以确定磷酸化组分的相对比例是否有变化。
如有必要,可采用其他方法进行验证,如质谱分析等。
综上所述,通过精心准备实验材料、优化实验步骤和注意实验条件控制等措施,可以轻松搞定磷酸化蛋白的WB检测。同时,也需要根据具体实验需求和条件进行灵活调整和优化。