一、样本制备
1.快速工作并保持低温环境
在样本制备过程中,应尽可能快地处理样品,以减少蛋白质降解的可能性。同时,保持操作环境在低温下进行,有助于维持蛋白质的稳定性和活性。
2.等量分装样品
如果需要对样品进行分装,请确保每份样品的量相等,以便后续实验中对不同样品进行比较。同时,这也有助于检查在样本制备过程中是否有目标蛋白质丢失。
3.优化裂解液的使用
对于浓度非常低的样品,建议使用高灵敏度底物和较少的裂解液,以提高检测的灵敏度。
如果裂解液中含有大量的DNA,可能会导致样品粘稠,难以移液,并可能在凝胶上产生条纹或污迹。此时,可以在添加上样缓冲液之前向裂解液中添加DNA酶。
4.变性凝胶的处理
在电泳前,将样品在98°C加热5分钟,可以使样品完全变性,并确保得到干净锐利的条带。
5.使用过滤后的缓冲液
在电泳前,应仔细检查缓冲液,确保其没有沉淀。使用过滤后的缓冲液可以减少对实验结果的影响。
6.小心操作凝胶梳子
在取下凝胶梳子时,请非常缓慢地进行,以免孔塌陷或扭曲,影响上样效果。
7.准确上样
使用上样器进行上样,确保将尖端尽可能靠近孔的底部,缓慢地加入样品,并小心地将上样器取出。在每个孔中加载相同的体积,不要空位。
二、转印过程
1.确保“三明治”结构材料尺寸相同
在转印过程中,滤纸、膜和凝胶的尺寸应相同,以防止气泡出现在膜上。气泡会影响蛋白质的转移效率,降低实验结果的准确性。
2.小心处理凝胶
从胶板中取出凝胶时,不要拉伸凝胶,以免损坏凝胶结构。用刀片从凝胶上取下底部和孔后,在凝胶上放置几片预先湿润的滤纸,轻轻地将其弄平。滤纸将作为支撑,小心地剥离凝胶。
3.去除气泡
使用圆形工具轻轻驱赶气泡,动作要轻柔,以免扭曲凝胶。气泡会影响蛋白质的转移效率,降低实验结果的准确性。
4.选择合适的转印方法
湿转:需要冰浴条件,适合大蛋白的转印。虽然相对较慢,需要大量的缓冲液,但可以获得高质量、清晰的条带和高效的转移。
半干转:比湿转快,使用较少的缓冲液,但比湿转效率低,特别是对于大蛋白。不需要冷却的环境,产热影响小。滤纸和膜剪裁时长宽应比凝胶小几毫米,否则影响蛋白质转移效率。
5.优化转印条件
根据蛋白质的大小和性质,调整转印条件,如电压、电流和时间等。对于大蛋白,可能需要使用低浓度的丙烯酰胺凝胶,并增加SDS和转印时间等。
6.使用高质量的膜和滤纸
选择高质量的膜和滤纸,如PVDF膜和硝酸纤维素膜等,可以提高蛋白质的转移效率,降低实验结果的变异性。
7.标准化数据
使用总蛋白质染色或加载对照抗体来标准化数据,可以提高实验结果的准确性和可靠性。例如,使用AzureRed总蛋白染色剂与荧光Western blot实验兼容,可进行多重荧光检测,定量更准确,使用更方便。