在 Western Blot(WB)实验中,内参的一致性对于准确分析目标蛋白的表达水平至关重要。传统上,我们依赖蛋白定量方法如 BCA 法来确保上样量的一致性,但在实际操作中,蛋白定量常常面临挑战,内参不齐的情况时有发生。
本文将探讨一种有趣的方法,即在加样后通过肉眼观察来初步判断内参是否齐整,为 WB 实验提供一种实用的补充策略。
一、传统蛋白定量方法的局限性
1.BCA 法原理及操作流程
BCA 法是一种常用的蛋白定量方法,其基于蛋白质与二价铜离子在碱性条件下的显色反应。
在碱性环境中,蛋白质将 Cu2 + 还原为 Cu+,Cu + 与 BCA 试剂形成紫色络合物,其颜色深浅与蛋白质浓度成正比。
通过测定在特定波长(通常为 562nm)下的吸光度,并与已知浓度的蛋白标准曲线进行比较,即可计算出样品中蛋白质的浓度。
2.实际操作中的问题
尽管 BCA 法具有较高的灵敏度和准确性,但在实际应用中仍存在一些局限性。
首先,操作过程中的微小误差,如试剂的配制、加样体积的准确性等,都可能对最终的定量结果产生影响。
其次,样本中的杂质(如还原剂、去污剂等)可能干扰 BCA 反应,导致定量不准确。
此外,对于某些特殊类型的蛋白质(如膜蛋白、糖蛋白等),BCA 法的定量结果可能存在偏差。
这些因素都可能导致上样量的不一致,进而影响内参的齐整性和实验结果的可靠性。
二、肉眼观察法的可行性探讨
1.实验观察现象
在文中提到的实验中,将 BCA 定量后稀释至 2μg/μL 的蛋白样品,每孔上样 10μL 后进行肉眼观察。发现红圈所在孔的样品颜色明显比另外三个孔深。
初步推测这可能意味着该孔的蛋白量较多,但也存在另一种可能,即变性时溴酚蓝添加量不准确,因为溴酚蓝是蓝色的,而蛋白样品本身无色,溴酚蓝的差异可能导致颜色视觉上的不同。
2.次日曝光结果验证
次日对 actin(一种常用内参蛋白)进行曝光后发现,上样时颜色深的两个孔条带相对于其他孔条带更粗且颜色更深。
这一结果表明,在该实验条件下,上样时肉眼观察到的颜色差异与最终的内参蛋白条带强度具有一定的相关性,初步支持了通过肉眼观察法来初步判断内参齐不齐的可行性。
3.可能的机制解释
虽然蛋白样品本身无色,但在电泳过程中,蛋白与染料(如溴酚蓝)共同迁移,蛋白含量较高的样品可能会携带更多的染料,从而在加样孔中呈现出较深的颜色。
然而,需要注意的是,这一机制并非绝对,溴酚蓝的迁移速度和上样时的分布均匀性等因素也可能影响观察结果。
因此,肉眼观察法只能作为一种初步的、辅助性的判断手段,不能完全替代传统的蛋白定量方法。
三、综合运用策略
鉴于肉眼观察法和传统蛋白定量方法各自的优缺点,在实际 WB 实验中,我们建议采取综合运用的策略。
首先,仍然以传统的蛋白定量方法(如 BCA 法)作为主要的定量手段,确保上样量的基本准确性。在加样后,利用肉眼观察法进行快速初步检查,如果发现明显的颜色差异或异常情况,可以及时对样本进行重新评估和处理,如检查定量过程是否存在错误、样本是否存在污染等。
通过这种方式,将两种方法有机结合,能够提高 WB 实验中内参一致性的保障程度,从而获得更可靠的实验结果。
在 Western Blot 实验中,内参的齐整性是实验成功的关键之一。
虽然肉眼观察法在判断内参齐不齐方面具有一定的可行性和优势,但也存在局限性。我们应将其作为传统蛋白定量方法的有益补充,而不是替代方法通过综合运用多种策略,不断优化实验操作,提高实验的准确性和可靠性,为生命科学研究提供有力的技术支持。
希望本文能够为广大科研工作者在 WB 实验操作中提供一些新的思路和参考,帮助大家更好地应对实验中可能出现的问题。