在 Western Blot(WB)实验中,配胶是一个关键步骤,而提前配胶和现配现用这两种方式各有特点。
一、提前配胶
1.优点
批量操作便利性:提前配胶能够实现批量配置,一次配置的凝胶可供多次使用。对于需要进行大量 WB 实验的实验室来说,这可以节省时间和精力。例如,在一些高通量的蛋白质组学研究中,每天可能需要对多个样本进行检测,如果每次都现配现用,会大大增加实验人员的工作量。
时间效率:从长远来看,提前配胶可以在实验安排上提供更多的灵活性。实验人员不需要在每次跑胶前都花费时间进行配胶操作,从而可以将更多的时间用于样本处理、数据分析等其他重要环节。
2.缺点
存相关问题:保存条件不当可能会引发一系列问题。如果凝胶暴露在空气中,水分蒸发可能导致干胶现象,这会直接影响电泳的效果,如电泳速度变慢。
因为干胶会改变凝胶的内部结构和孔隙率,使得蛋白质在凝胶中的迁移受到阻碍。
此外,干胶还可能导致条带扭曲,这是由于凝胶的不均匀性增加,蛋白质在电场中的受力情况变得复杂,无法按照正常的规律迁移。
使用期限限制:即使在合适的保存条件下,凝胶的质量也会随着时间的推移而下降。一般建议在 3 天内使用提前配置的凝胶,超过这个时间,条带的质量可能会受到影响,出现模糊、变形等情况。这是因为随着时间的延长,凝胶中的一些成分可能会发生变化,如缓冲液的成分可能会因为扩散或化学反应而改变,从而影响凝胶的电泳性能。
3.使用建议
为了减少保存过程中的问题,应将充分凝固的胶放在去离子水或电泳液中完全浸没。
去离子水可以防止凝胶干燥,同时避免引入其他杂质。将其置于 4℃冰箱中保存,低温环境有助于减缓凝胶中成分的变化速度。
但需要注意的是,即使采取了这些措施,也应尽量在 3 天内使用凝胶,以确保获得较好的实验结果。
二、现配现用
1.优点
稳定性高:现配现用的凝胶相对更加稳定,实验人员不需要担心凝胶在保存过程中出现质量问题。因为凝胶是在使用前即时配置的,其成分和结构都处于最佳状态,能够为蛋白质的电泳提供良好的环境。
结果可靠性:由于凝胶的新鲜度和稳定性,在理想的操作条件下,现配现用可以获得更可靠的实验结果。条带的清晰度、形状和位置等都更符合预期,这对于准确判断蛋白质的分子量和含量等信息非常重要。
2.缺点
时间成本:现配现用需要在每次跑胶前都进行配胶操作,这无疑会增加实验的时间成本。特别是在需要进行大量样本检测或者时间紧迫的情况下,这种方式可能会导致实验进度延迟。
操作要求严格:如果在配胶过程中没有给予足够的时间让凝胶充分凝固,会出现胶孔不平或有絮状物的情况。胶孔不平会影响上样的准确性和均匀性,导致样本在凝胶中的分布不均匀,进而影响电泳结果。而絮状物可能会堵塞胶孔或者与蛋白质发生非特异性结合,干扰蛋白质的正常迁移。
三、综合比较与选择建议
1.实验结果差异
在操作得当的情况下,在 3 天内使用两种方式其实没有太大差别。这意味着如果能够满足各自的操作要求,无论是提前配胶还是现配现用,都可以获得较为满意的实验结果。
2.选择依据
实验室习惯和资源:每个实验室都有自己的工作习惯和资源配置。如果实验室人员充足,时间相对宽松,且注重实验结果的准确性和稳定性,现配现用可能是更好的选择。
相反,如果实验室需要处理大量样本,且时间紧迫,提前配胶可以提高工作效率,但需要注意严格控制保存条件。
试剂和环境因素:不同品牌的试剂可能会对配胶和电泳结果产生影响。有些试剂可能更适合现配现用,而有些则在提前配胶时表现更好。
此外,实验室的环境温度、湿度等因素也需要考虑。例如,在高温潮湿的环境下,提前配胶的保存难度可能会增加,此时现配现用可能更为合适。