一、未提取到DNA
1.问题分析:
样本质量不佳,如样本老化、降解或含有抑制物。
裂解不充分,未能有效释放DNA。
漂洗液中未添加无水乙醇或异丙醇,导致DNA无法沉淀。
2.解决方案:
选择新鲜、高质量的样本。
优化裂解条件,如延长裂解时间、增加裂解液用量或采用更有效的裂解方法。
确保在漂洗液中加入指定量的无水乙醇或异丙醇。
二、DNA产量低
1.问题分析:
样本量不足或含有DNA的细胞数量少。
裂解不充分,导致DNA释放不完全。
洗涤或纯化过程中DNA丢失。
2.解决方案:
增加样本量或选择富含DNA的细胞类型。
优化裂解条件,确保DNA充分释放。
在洗涤和纯化过程中,小心操作,避免DNA丢失。
三、DNA纯度低
1.问题分析:
样本中含有蛋白质、多糖、多酚等杂质。
提取过程中引入了外源DNA酶或RNA酶。
洗涤不彻底,导致杂质残留。
2.解决方案:
在提取过程中加入蛋白酶K等酶类,去除蛋白质杂质。
使用高质量的试剂和耗材,避免引入外源酶。
增加洗涤次数或使用更有效的洗涤方法,确保杂质彻底去除。
四、DNA降解
1.问题分析:
样本在提取前未妥善保存,导致DNA降解。
提取过程中操作过于剧烈,导致DNA机械断裂。
提取过程中引入了DNA酶。
2.解决方案:
样本采集后应尽快处理或妥善保存于低温条件下。
提取过程中操作应轻柔,避免剧烈振荡或吹打。
使用高质量的试剂和耗材,避免引入DNA酶。
五、DNA片段长度小于预期
1.问题分析:
DNA在提取过程中发生降解。
裂解或纯化过程中使用了不适当的条件,导致DNA剪切。
2.解决方案:
优化样本保存和提取条件,减少DNA降解。
使用温和的裂解和纯化条件,避免DNA剪切。
六、A260/A280值异常
1.问题分析:
A260/A280值小于1.8,可能存在蛋白质、酚类等杂质污染。
A260/A280值大于2.0,可能存在RNA污染。
2.解决方案:
重新提取DNA,确保去除蛋白质、酚类等杂质。
在提取过程中加入RNaseA等酶类,去除RNA污染。
七、离心柱堵塞
1.问题分析:
样本中含有大量杂质,导致离心柱堵塞。
离心柱质量不佳或使用不当。
2.解决方案:
预处理样本,去除杂质。
使用高质量的离心柱,并严格按照说明书操作。
八、PCR反应受抑制
1.问题分析:
提取的DNA中含有抑制PCR反应的杂质。
DNA纯度低,含有蛋白质、多糖等杂质。
2.解决方案:
重新提取DNA,确保去除抑制PCR反应的杂质。
提高DNA纯度,去除蛋白质、多糖等杂质。
提取过程中的注意事项
1.样本选择和处理
选择新鲜、高质量的样本。
样本采集后应尽快处理或妥善保存于低温条件下。
2.裂解条件
根据样本类型选择合适的裂解方法和条件。
确保裂解充分,释放DNA。
3.纯化步骤
选择合适的纯化方法和条件。
增加洗涤次数或使用更有效的洗涤方法,确保杂质彻底去除。
4.试剂和耗材
使用高质量的试剂和耗材,避免引入外源酶和杂质。
严格按照说明书操作,避免操作失误。
5.实验环境
保持实验环境整洁、无菌。
避免交叉污染。